近日,中国农业科学院植物保护研究所教授周雪平团队与北京市农林科学院研究员李少芳团队联合在《科学通报》(science bulletin)在线发表研究论文。研究综合运用三种原理不同的m?a检测方法,揭示了侵染西瓜的两种细胞质复制型rna病毒——瓜蒌斑驳花叶病毒(trmmv)和西葫芦黄花叶病毒(zymv)的rna中缺乏n?-甲基腺苷(m?a)修饰,为植物病毒表观转录组学研究提供了新见解。
n?-甲基腺苷(m?a)是真核生物mrna中最常见的内部修饰,发生于腺苷酸第六位氮原子上,在基因表达调控中发挥重要作用。该修饰主要由定位于细胞核的甲基转移酶复合物(mtc)催化完成。尽管m?a表观转录组测序技术显著推动了该领域的研究,但容易产生的假信号可能导致一些错误结果。
研究聚焦侵染西瓜的两种细胞质复制型病毒trmmv与zymv。研究结果显示,这两种病毒rna不含m?a修饰。
该研究揭示,细胞质复制型植物rna病毒中,m?a修饰可能并非普遍存在。该结果不仅凸显了在病毒及寄主内源rna表观修饰研究中设置严格阴性对照的关键作用,也为未来相关研究提供了降低假阳性、实现无偏倚检测的重要方法学策略。
植保所博士生潘福安、博士后荆嘉贤为论文共同第一作者,周雪平和李少芳为共同通讯作者。该研究得到了国家重点研发计划、北京市蔬菜研究中心创新发展项目及高层次人才启动基金支持。
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